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沃特世RNA分析工具再升級，MAP Sequence 2.0助力mRNA及sgRNA序列分析

近年來，長鏈RNA治療藥物和疫苗（如CRISPR sgRNA、mRNA）發(fā)展迅速，其長度可達數(shù)百至數(shù)千個核苷酸。由于僅靠完整質(zhì)量分析難以**評估其特性，需采用酶切策略確認序列并檢測修飾。

近年來，以長鏈RNA為基礎的治療藥物（CRISPR sgRNA、mRNA）和疫苗發(fā)展迅速，這類RNA的核苷酸長度從100個到數(shù)千個不等，與長度相近的蛋白質(zhì)類似，僅通過完整質(zhì)量分析無法**了解其特性。需要借助基于酶切的策略來確認序列，并評估靶向修飾和非預期修飾。

**的MAP Sequence 2.0 App能夠通過LC-MS分析寡核苷酸序列圖譜，確認長鏈RNA分子的完整性、線性序列和修飾情況。用戶通過序列特異性RNase酶對RNA進行酶切，生成可預測的酶切寡核苷酸產(chǎn)物后，可通過LC-MS^E對這些酶切寡核苷酸進行分析，構(gòu)建寡核苷酸圖譜。這一過程類似于酶切蛋白質(zhì)后的肽圖分析。而MAP Sequence信息學工具會利用質(zhì)量和碎片信息，將圖譜中的峰與酶切片段進行匹配。

圖1. 使用MAP Sequence 2.0版比較sgRNA經(jīng)三種酶（RapiZyme Cusativin、RapiZyme MC1和RNase T1）酶解后獲得的序列覆蓋率。合并序列覆蓋率表明，通過工作流程中概述的復合酶解方法，可以實現(xiàn)沃特世sgRNA的完整序列表征。

MAP Sequence 2.0 App具有以下優(yōu)勢功能：

能夠原生處理來自 BioAccord、Xevo G3 QTof和Xevo MRT系統(tǒng)的數(shù)據(jù)，可以根據(jù)自身對可用性、靈敏度和質(zhì)量準確度的需求選擇合適的平臺。

具備整合多次圖譜分析結(jié)果，和靈活支持多種酶切策略的能力，為實現(xiàn)高可信度的高序列覆蓋率提供了較大可能。

提供多種用于數(shù)據(jù)審查和報告的數(shù)據(jù)及結(jié)果可視化工具，能夠清晰、簡潔地呈現(xiàn)圖譜中單個酶切寡核苷酸的結(jié)果，以及整個分子圖譜的匯總結(jié)果。

搭載在waters_connect質(zhì)譜軟件平臺，作為一款合規(guī)軟件，waters_connect可部署于產(chǎn)品及工藝研發(fā)階段的RNA表征工作，也可用于構(gòu)建經(jīng)驗證的常規(guī)分析方法，在受監(jiān)管的生產(chǎn)與產(chǎn)品放行流程中監(jiān)控這些關鍵屬性。